Les microbiomes ne sont pas seulement des indicateurs de l'état de leur environnement ou de la santé de leur hôte. Ce sont des écosystèmes à part entière, façonnés par des forces et des dynamiques similaires à celles étudiées dans les autres domaines de l'écologie scientifique.

Cette session de 3 jours en écologie des communautés microbiennes a pour objectifs de :

  • rassembler des scientifiques (chercheur.e.s, ingénieur.e.s...) issus de laboratoires associés à l'initiative clé CLAPAS, travaillant sur les communautés microbiennes dans divers contextes tels que la santé animale, humaine et végétale, ainsi que les agro-systèmes.

  • aider à créer un langage commun par des formations chaque matin, avec un aperçu des idées et outils clés couvrant l'écologie des communautés (de la coexistence aux réseaux complexes), suffisamment général pour s'appliquer à différents systèmes microbiens.

  • favoriser, dans un atelier chaque après-midi, de nouvelles collaborations et de nouvelles manières d'aborder les données, les expériences ou l'enseignement de ce sujet, à travers divers formats de discussions et de sessions de travail en groupe.

    • Pour postuler, veuillez remplir ce formulaire avant le 31 mars 2025.

      Voir aussi : l'édition précédente (automne 2024) qui a impliqué 10 doctorants.

      Dates et lieu

      Date limite de candidature : 31 mars 2025

      Dates : Dimanche 27 avril, 17h00 au mercredi 30 avril, 12h00

      Lieu : L'école se déroulera sur le campus INTP à Surba, un petit village dans les Pyrénées ariégeoises, accessible en train depuis Toulouse (gare la plus proche : Tarascon-sur-Ariège).

      Tous les frais seront pris en charge par l'initiative clé CLAPAS pour les candidats sélectionnés des laboratoires associés, y compris les frais de scolarité, d'hébergement et de transport. Quelques candidats non associés à CLAPAS pourraient être acceptés si disponibilités, mais devront payer les frais (contactez-nous).

      Nous offrons la possibilité de prolonger le séjour jusqu'au 1er mai et jusqu'au week-end pour plusieurs participants, cette prolongation n'étant pas financée par l'initiative CLAPAS. Les conditions et frais pour les jours supplémentaires seront les mêmes que pour les résidences de recherche à INTP.

      Programme

      Dans ce format hybride de l'école et de l'atelier, il y aura des conférences le matin, destinées aux chercheurs en activité, visant à fournir un moyen de recontextualiser leurs connaissances et de les connecter à d'autres domaines.

      L'objectif des conférences sera de partager des idées et des outils transférables entre les biomes et entre l'écologie des communautés traditionnelles et microbiennes. Le langage des modèles et de la théorie sera nécessaire pour cette traduction, mais le contenu est destiné à être utile pour la recherche observationnelle et expérimentale.

      Les sessions de l'atelier l'après-midi prendront différentes formes, comprenant des discussions en intérieur et en extérieur, des sessions de codage et d'analyse de données, des présentations courtes, des clubs de lecture, etc.

      Intervenants : Matthieu Barbier (CIRAD), Azenor Bideault (U Laval).

      Arrivée possible dès le matin du dimanche 27.

      Dimanche 27
      17h00-20h00 Présentations de recherches courtes par tous les participants

      Lundi 28
      9h00-12h30 Conférences : Introduction + Théorie de la biodiversité et de la coexistence
      14h00-19h00 Groupes de travail et discussions

      Mardi 29
      9h00-12h30 Conférences : Rôles fonctionnels + Réseaux écologiques
      14h00-19h00 Groupes de travail et discussions

      Mercredi 30
      9h00-12h00 Conférences : Complexité, stochasticité et historicité + Conclusions
      12h00-19h00 Temps libre et activités extérieures optionnelles, départ

      Activités supplémentaires

      Un guide local proposera des activités de montagne pour un supplément le vendredi après-midi, soit de l'escalade, soit de la via ferrata, si suffisamment de participants s'inscrivent à l'avance.

      Frais supplémentaires : 50 euros.

      Alternativement, nous aiderons les participants à planifier d'autres activités (randonnée, visite de grottes préhistoriques ou de villes voisines, etc.).